有人认为SEED太过简单，做攻略多此一举。但个人认为，对新手来说还是有解释解释的必要的。
系统解析：
本作沿用了NEO的战略系统而略微有了些更新，所以玩过NEO的玩家都能很快上手。
战斗：前作的小队系统、复数射击、支援和援护系统都完全不变地保留了下来，新加入了“复数格斗”这一技能，条件是机师格斗值达到40，或觉醒50以上，效果是有此技能的机师可在近距离范围内对两个敌人同时做出攻击且只消耗一次EN（说白了就是复射的近距离版）。另外，本作取消了米氏粒子浓度的设定。
SA攻击由前作的一次变为了三次。和前作一样，注意SA攻击获得经验值是翻倍的（这次在武器效果栏里有提示），所以强悍的敌人最好用SA将其干掉。ZOC系统保留，在S模式阿拉丝加脱出一话中大家可见识到此系统的有用之处。
和NEO不同，在本作中用地图武器击坠敌人是可以得到经验值的，每击坠一个敌人获得EXP.100，可以累积。和普通SA攻击不一样，SA属性的地图武器是没有击坠敌人经验值*2的设定的，注意。
在前作中，浮游炮就是必中+高伤害的代名词，尤其是必中效果，只是一次攻击命中在1-5之间罢了。本作中的浮游炮依然牛B，但是有可能完全避开的。敌方对我方的浮游炮攻击，基本如果命中在15%以下就打不到了。（不过SD系列的敌人RPWT特别严重，10%全中还是有可能的）我印象最深的就是Special模式的鸭子逆袭，柯丝的Alpha瓦索龙40%的浮游炮*2被胡索给完全回避了……
人物：本次原创部队人物加入方法从剧情发展变成了花钱克隆人
，由此造成了某些同志N代同堂的局面。所有机师的初始等级为1，上限99（接NEO记录会附加较高等级机师，Lv取决于NEO的周目数，周目数越高，Lv也高）可雇佣机师通过两种方式加入，一是当其使用的机体成为ACE，在过关捕获机体清算或机体开发时，系统会提示人物可操作登陆信息；二是过关附送。
人物升级：一般人物一次升级所加能力总值在2-3徘徊，但也有例外，某些人的增加数值是根据Lv的，当Lv递增时所加数值递减（基本以20极为一档）比如偶的捷多，Lv.1-20加5，Lv.21-40加4……以此类推，升级所加数值到3时恒定。具体加在那项能力上是随机的，所以可以用S/L控制。根据等级增加升级数值的人一般成长率较高，现发现有卡缪、捷多、胡索、W系列五只蟑螂等等……尤其是胡索，有时竟然升一级总值加6……不过本作可以反复打某一话，所以反复拣增值道具也是练人的一种办法。
其他：取消了科技等级，加入了无限重打，所以本作练人练机极其方便。战舰在本作里是不能购买的，而是作为过关奖励出现。前作与科技等级有关的战舰能力提升、捕获机体数量和机体芯片，在本作里也都以过关奖励的方式出现。这次过关后会有系列开发图纸的奖励，算是个体贴的设定，起码在开发机体时一目了然，用不着瞻前顾后了。
G世纪一向注重的收集工作当然是最大的卖点，除机体人物战舰CG动画外，这次还比NEO多了地图兵器攻击动画、过场静态画面和SEED专用的情节CUT-IN的收集……其他的诸如音乐欣赏模式的变化之类的，就不再多罗嗦了。
